得到消息的小早川隆景也匆忙放弃与两村上水军众合流的打算，做好了只靠小早川军进攻的准备。此时大内家水军有战船五百艘，而川内水军只有战船五六十艘、小早川水军则是六、七十艘。

当然，毛利元就也不忘派人向孙女婿来岛通康请求派出水军众支援，只是来岛通康却一时没有任何回复。

到了九月二十八日，来岛水军众终于赶到，原本只能隔岸观火的毛利军终于获得了主动权。于是，毛利元就就趁机利用当天的大雨进行掩护， 利用水军众的协助，趁夜偷偷渡海。

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毛利元就、毛利隆元、吉川元春率领的毛利军本队二千人在严岛东北岸的鼓之浦登陆，上岸之后，毛利军以吉川元春作为先锋，登上了陶军本阵后方的尾之丘。

与此同时，小早川隆景率领的小早川水军、能岛、来岛村上水军则按原定计划迂回到了严岛西北部的海上，趁着夜色的掩护装作是从北九州前来支援大内军的水军，准备在击溃大内家水军之后，率领一千五百人的小早川军趁机在岸上登陆。

拂晓，毛利军立即对严岛的大内军发起突袭。随着毛利元就一声令下，伴随着太鼓声以及喊杀声，毛利军本队以及小早川队、宫野城的守军都对陶军发起了奇袭。

大内军因为并没有在严岛长期作战的打算，因此两万人密集地驻扎在了严岛东北部的狭小的土地上，在遭到毛利军的奇袭之后，大为惊慌，虽然有作反击，但是以全局来说仍然是全军崩溃，朝着西方败走。

然而，此时可以依赖的大内家水军众也遭到了小早川军的袭击而败走，大内军最终成了严岛上的瓮中之鳖，根本无法逃脱。在以陶晴贤为首的大内家诸将们在失去后路的绝境之下，最终全部阵亡。

至此，严岛之战以毛利军的大获全胜而告终，陶晴贤、弘中隆兼等大内家诸将悉数于此战中阵亡后，大内家更是人才凋零、元气大伤。

毛利家则是与之相反，在严岛之战后更是乘胜追击，直接挟大胜之余威攻入周防国，兵锋直指大内领腹地。