在香港电影新浪潮方兴未艾之际，牟敦芾来到香港，签约邵氏公司成为旗下导演，首部电影执导了【香港奇案】中的【枪】，上映后反应良好，牟敦芾一度被邵氏寄予厚望，不过谁都没有想到，牟敦芾后来的名衔却是“邵氏最热衷视觉暴力的邪片导演”。

1978年牟敦芾拍了一部讲述大陆偷渡者在香港遭遇的【捞过界】，1980年又根据真人真事拍摄了【打蛇】，影片中有一场群体裸露戏，因为临时间找不到那么多的裸体演员出演“人蛇”（即偷渡者），牟敦芾就把真的偷渡者找来拍戏，而片中变态暴力场面数不胜数，一次次挑战观众的承受极限，当时就有影评人大骂牟敦芾“兽性大发，毫无人道可言。”

香港人接受不了这个故事，他们觉得自己没有那么坏，但实际上“人蛇”的遭遇比影片中表现得还要凄惨，关于是否要禁映这部电影有过很大的社会争议，审查部门和社会舆论都无法接受牟敦芾在电影里搞这么多的变态暴力，但牟敦芾却坚持认为，只有渲染真实的人类兽性才能突出自己一直要表达的政治社会性。

可惜面对电影里那些极度暴力场面，观众除了生理和心理的极度不适应之外，却没有更多人能够理解牟敦芾的苦心。

一向是“唯利是图”的邵氏这次也怕了，虽然【打蛇】的票房不错，但邵氏公司也因此承担了很大的社会舆论压力，在被邵氏高层找去谈话，提醒不要“太过界”之后，牟敦芾索性就和邵氏解约，跑到大陆去给夏梦的青鸟公司拍戏。

一开始牟敦芾帮青鸟公司拍出【自古英雄出少年】这样的喜剧功夫片的时候，所有人都以为他转性了，但很快就传出消息，牟敦芾居然想把“731”的故事搬上银幕。

为了搜集素材，牟敦芾花了四年的时间走遍日本美国，等准备开始拍摄的时候，却发现阻力重重。

80年代的中国和日本外交关系正处于蜜月期，各自都需要对方，中国需要日本投资，而日本则需要中国的资源产品。牟敦芾拍摄这部电影时必须向政府申请拍摄许可才能拍摄。为此牟敦芾还向中央委员会以及总书记直接递交过一份报告，并在报告里写过“你要么让我拍，要么你就是个汉奸”类似这样的话。

中央政府担心影片的731题材会伤及中国和日本两国之间的关系，牟敦芾却固执己见，他觉得拍的电影是关于过去的，这是一部真实的电影，虽然目前中国和日本的关系很和谐，但并不能改变731部队和他们所做实验的历史，之后中央政府才给他亮了绿灯。

但是问题并没有结束，下面的官员又来找他麻烦，尤其是外交部，他们反对牟敦芾拍摄【黑太阳731】，理由是“目前中日关系良好，希望暂缓拍摄”。

别的导演遇到这样的事情可能就屈服了，但牟敦芾却很强硬，他直接质问外交部来人，是否要给总书记写一封信来告知这个情况，外交部那边这才无话可说。

牟敦芾花了6个月时间拍摄完成了这部电影，戏中充斥着731部队各种虐杀中国人的惨状，为了突出真实性，牟敦芾采取了一种很不人道的拍摄手法，花了很长时间等公安局运尸体来拍。

牟敦芾拍【黑太阳731】完全是出于一种社会责任感，要向世人揭露日军当年的罪行，但影片以完全实录的方式直接展现血淋淋的暴力兽行，还是让很多观众感到极度不适，影片在香港上映时，就有香港媒体结合牟敦芾以前的“劣迹”，批评他是在“制造噱头贩卖暴力”。

而这部电影在日本只放过一次，在一家电影院里，放过之后电影院接到了一通电话，电话威胁他们如果敢继续放映的话，电影院就会被纵火，而牟敦芾也将会有生命威胁。牟敦芾不受威胁，但是电影院方面还是终止了放映，不过戏剧性的是，这部电影片在日本的录像带市场上居然卖出了不错的销量。

【黑太阳731】拍完之后，大陆方面一直压着没让上映，搞得现在牟敦芾在很多人眼中都是一个非常棘手的家伙，找他拍戏几乎是要冒着同时得罪大陆、日本的风险，而对于只以追逐商业利益为目标的香港电影公司来说，牟敦芾更是直接被划入了黑名单。

换作是别人推荐牟敦芾，邹文怀、何冠昌肯定想都不想就直接拒绝，但推荐人是林宥伦，两人就不得不犹豫起来。