崇祯皇帝通过洪承畴身上的甲级窃听种子了解到前方的战况之后，就加快了行军速度，带着骠骑营在崇祯二十二年六月二十二赶到了哈密。

这个时候，吕大器所部的大明骑军，或者现在应该叫步卒，已经康复地差不多了。不过吕大器本人的身体，因为年事已高，恢复地并不好。

崇祯皇帝到达之后，首先便对第一次战事做出了定性：这是一场大捷，粉碎了准葛尔部叛逆的阴谋，在哈密坚守无投降，正是体现了大明坚强不屈，保家卫国的军魂，因此，所有在哈密坚守的大明将士，均被记功，并受哈密纪念章一枚。

甘肃巡抚吕大器有过有功，但功大于过，升左都御史，兼太子少保，准其告老还乡，休养身体。

另外，哈密之战中战死将士，全入大明忠烈祠享大明香火，家属按律得到优待；

但是，在哈密之战中溃逃的那一部分，就和当初辽东部族投降大明一样，全部降为奴隶兵，准他们随军继续作战，戴罪立功者方能重新转为正式的大明将士。当然，对于那些百户以上军官溃逃的，崇祯皇帝没有手软，军前斩首示众！

雷厉风行地做出了赏罚之后，崇祯皇帝的身边，就是四万左右洪承畴所部，以及一万多骑骠骑营将士，人数重新达到了五万多人。

不过这其中，有五千多成了步卒。这些人就不方便继续随军，因为赶不上大军行进速度。因此，崇祯皇帝下旨，他们在哈密就地驻守，修筑哈密，为将来大明掌控西域做准备。

然后，他就领着四万五千多骑，再次西征，从哈密浩浩荡荡地出发了。

这一次，全军并没有分散，所有骑军，都合在一起，最多各部之间，相差一日行程，分散成南北两线，向乌鲁木齐方向推进。

当然，崇祯皇帝这么做，并不是没有一点目的的。

在哈密出发之前，他就释放了十二名准葛尔部骑军的俘虏，明确告诉他们道：“朕来了，给你们准葛尔部最后一次机会。朕会在轮台等你们，期限半个月，立刻无条件投降。过期不候，灭族！”

这十二名准葛尔部的倒霉蛋是在洪承畴所部救援的过程中，俘虏的没能及时逃走的准葛尔部哨探。他们原本以为会被明国皇帝杀了祭旗，没想到还有命活着回去，不管他们是否真心，都是连声答应，保证把话带到。

他们自然不会想到，崇祯皇帝在他们之中的三个小头目身上，各自放了一颗甲级窃听种子。把这些人放回去，就能让他找到准葛尔部骑军躲藏的地点。要没有这个金手指的话，而且他们不投降大明，那就真得是杀了祭旗了。

所谓轮台，其实就是后世的乌鲁木齐，是贞观年间大唐始设。唐代著名边塞诗人岑参曾在此留下“忽如一夜春风来，千树万树梨花开”等脍炙人口的诗句。

这里北上就是准格尔盆地，南下就是伊犁地区，西进则是塔城地区，是准葛尔部原本活动区域的中心位置。